1999年アニメ21位 デジモンアドベンチャー（アニメ映画）
| 放送 | 1999年3月6日 |
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1999年放送アニメ
1999年アニメ21位 星界の紋章（TVアニメ動画）
| 放送 | 1999年冬アニメ |
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1999年アニメ23位 おジャ魔女どれみ（TVアニメ動画）
| 放送 | 1999年冬アニメ |
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1999年アニメ24位 サクラ大戦轟華絢爛（OVA）
| 放送 | 1999年12月18日 |
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1999年アニメ25位 真ゲッターロボ世界最後の日（OVA）
| 放送 | 1999年2月25日 |
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1999年アニメ26位 今、そこにいる僕（TVアニメ動画）
| 放送 | 1999年秋アニメ |
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1999年アニメ27位 メダロット（TVアニメ動画）
| 放送 | 1999年夏アニメ |
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1999年アニメ27位 逮捕しちゃうぞtheMOVIE（アニメ映画）
| 放送 | 1999年4月24日 |
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1999年アニメ29位 劇場版ポケットモンスター幻のポケモンルギア爆誕（アニメ映画）
| 放送 | 1999年7月17日 |
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1999年アニメ29位 ターザン（アニメ映画）
| 放送 | 1999年12月1日 |
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1999年アニメ31位 ToHeart[トゥーハート]（TVアニメ動画）
| 放送 | 1999年春アニメ |
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1999年アニメ32位 臣士魔法劇場リスキー☆セフティ（TVアニメ動画）
| 放送 | 1999年秋アニメ |
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1999年アニメ32位 てなもんやボイジャーズ（OVA）
| 放送 | 1999年6月25日 |
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1999年アニメ34位 バグズ・ライフ（アニメ映画）
| 放送 | 1999年3月1日 |
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1999年アニメ35位 クレヨンしんちゃん爆発！温泉わくわく大決戦（アニメ映画）
| 放送 | 1999年4月17日 |
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1999年アニメ36位 金田一少年の事件簿２殺戮のディープブルー（アニメ映画）
| 放送 | 1999年8月21日 |
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1999年アニメ37位 アキハバラ電脳組2011年の夏休み（アニメ映画）
| 放送 | 1999年8月14日 |
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1999年アニメ38位 機動戦士ガンダム第08MS小隊ラスト・リゾート（OVA）
| 放送 | 1999年7月25日 |
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1999年アニメ38位 サイボーグクロちゃん（TVアニメ動画）
| 放送 | 1999年秋アニメ |
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1999年アニメ38位 アレクサンダー戦記（TVアニメ動画）
| 放送 | 1999年夏アニメ |
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