ハヤブサのカイは、父テンダイと一緒にアフリカのカトゥングで暮らしていた。
テンダイは心優しい父だったが、他に仲間も友達いない暮らしにカイは寂しさを感じていた。
そんな中、コウノトリのゴーゴーが卵を運ぶ途中でハゲコウ軍団に襲われ、カトゥングに迷い込んでくる。
ゴーゴーが暮らす鳥の都ザンベジアと、都を守るハリケーン隊の活躍を聞かされたカイは、父の制止を振り切りザンベジアへと飛び立つ。
一方、鳥たちから仲間外れとなったハゲコウ軍団は、凶暴なイグアナのブッゾと協力してザンベジアを乗っ取ろうと企てるが…。
